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项目文章 (Nat Commun IF 15.7)| 超高深度血液蛋白组学佳作!破解乙肝相关肝衰竭继发感染预测难题

发布时间:2026-03-16

在肝病诊疗领域,如何早期识别乙肝相关肝衰竭患者的继发感染风险一直是临床痛点。由于继发感染在早期往往缺乏典型的临床症状,致使约三分之一的感染病例直至患者入院后才被察觉,大幅增加患者死亡风险。

2026年3月3日,首都医科大学附属北京地坛医院金荣华院长,侯艺鑫主任,孙亚民研究员团队Nature Communications杂志上发表题为“Proteomics-based machine learning model for predicting secondary infection in HBV-related liver failure”文章。本研究通过蛋白质组学与机器学习相结合的方法,开发出可早期预测继发感染的创新模型。首次系统描绘了乙肝相关肝衰竭继发感染的蛋白质组学图谱,为临床早期干预提供了全新的解决方案。拜谱生物为该研究提供了超高深度血液蛋白质组和PRM靶向蛋白质组技术服务。

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英文标题:Proteomics-based machine learning model for predicting secondary infection in HBV-related liver failure

中文标题:基于蛋白质组学的机器学习模型用于预测HBV相关肝衰竭的继发感染

客户单位:首都医科大学附属北京地坛医院

研究材料:血浆

拜谱提供技术超高深度血液蛋白质组和PRM靶向蛋白质组、机器学习分析

技术路线

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研究结果

1、从临床痛点出发:明确继发感染(SI)预测的未满足需求

为了突破传统预测模型的局限性,研究团队首先系统分析了乙型肝炎病毒(HBV)相关肝衰竭患者继发感染的临床特征。通过前瞻性多中心研究设计,在发现队列纳入114例患者,两个验证队列各纳入60例患者,发现SI患者普遍存在更严重的肝功能损伤、高黄疸水平以及凝血功能障碍。值得注意的是,入院时常规炎症标志物(如CRP、WBC)在SI与非SI患者间无显著差异,凸显了传统指标在早期预测中的局限性,也印证了开发新型分子预测模型的必要性。

2、血液蛋白质组学发现:揭示SI的分子特征

为探索继发感染的分子机制,研究团队对发现队列进行DB纳米磁珠富集(DBE kit)的非靶向血液蛋白质组学分析,共鉴定出974个差异表达蛋白(DEPs),其中炎症相关蛋白占27%,凝血相关蛋白占19%(图1a-c)。KEGG通路富集分析,显示血小板激活、补体凝血级联等通路显著失调。

进一步的相关性分析揭示了炎症与凝血系统的密切交互:炎症蛋白CALCA、SAA2与CRP呈强正相关,而凝血相关蛋白PLAT与CRP呈显著负相关;凝血指标PT、INR则与炎症调节因子TNFAIP6、IL1RL1等显著相关(图1d-g)。这些发现首次从分子层面证实了炎症-凝血轴在SI发病中的核心作用

图片图1 非靶向血液蛋白质组学在发现队列中的结果编辑

3、靶向蛋白质组学:验证关键标志物

基于非靶向的发现,研究团队在验证队列中采用PRM靶向蛋白质组学技术对31个候选蛋白进行验证。结果显示,继发感染组中炎症/免疫相关蛋白占24%,凝血相关蛋白占27%,进一步证实了炎症-凝血失衡的核心作用(图2a-c)。

相关性分析发现,凝血因子F2、ITGA2B、Serpin C1等与CRP、NE%显著相关,而急性期反应蛋白SAA1、S100A9、LYZ等与PT、INR呈强正相关(图2d)。这些靶向验证结果为模型构建提供了可靠的分子标志物。

图片图2 靶向蛋白质组学在验证队列中的结果编辑

4、机器学习建模:构建预测性能卓越的模型

为实现精准风险预测,研究团队比较了五种机器学习算法,最终选择逻辑回归(LR)作为核心分类器,基于mRMR算法筛选的10个核心蛋白标志物(CALM1、LYZ、TMSB4X、GC、CRP、Serpin D1、DPT、A2M、PF4V1和SNCA)(图3d-f),结合AST和Tbil水平,研究团队构建了逻辑回归预测模型(Model 1)。进一步筛选出6个独立预测因子:4个蛋白标志物(LYZ、CALM1、Serpin D1、DPT)和2个临床指标(AST、Tbil)作为预测模型(Model 2)。

图片图3 模型1在发现队列中的表现编辑

在发现队列中,Model 1的AUROC达0.980,优于Model 2(0.973)、传统炎症指标CRP(0.645)、WBC(0.674)和NE%(0.642)。在28天死亡率预测方面,Model 1 AUROC达0.883,优于CLIF-C ACLF评分(0.545)。(图4)

图片图4 多种模型在发现队列中的表现编辑

5、多维度验证:确证模型的稳健性与临床适用性

在验证队列中,Model 1持续保持高预测准确性(AUROC=0.873),且显著优于其他指标(图5)。通过ELISA技术对核心蛋白标志物进行定量验证,发现LYZ在SI患者中显著升高,而CALM1、Serpin D1和DPT水平降低。基于ELISA数据的模型同样达到0.883的AUROC值,证实了其临床应用的可行性

图片图5 模型在验证队列中的表现编辑

文章小结

本研究通过系统的蛋白质组学分析与机器学习建模,成功开发出可早期预测乙肝相关肝衰竭继发感染的风险评估模型。四个蛋白标志物(LYZ、CALM1、Serpin D1、DPT)与两个临床指标(AST、Tbil)的组合在多个独立队列中展现出优异的预测性能,并在ELISA平台上得到验证。该研究不仅揭示了炎症-凝血失衡在继发感染发病中的核心作用,更为临床提供了可在入院48小时内识别高危患者的实用工具,有望显著改善这类危重患者的临床预后。

拜谱小结

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参考文献

Xiong F, Zheng J, Chen J,et,al. Proteomics-based machine learning model for predicting secondary infection in HBV-related liver failure. Nat Commun. 2026 Mar 3. doi: 10.1038/s41467-026-69075-y. Epub ahead of print. PMID: 41776162.