基于质谱的蛋白质组学工作流程通常包括多个步骤,包括细胞裂解、蛋白提取、消化和脱盐,不同的步骤带来了一些挑战,包括潜在的样品污染和损失,重复性等问题,阻碍了微量样本的质谱检测。尽管已经开发了多种针对微量样本的前处理流程,如SISPROT、SP3等,但是这种方法对极微量样本的蛋白检出量有限。
基于此,拜谱生物全新推出了极微量蛋白质组学,采用一步样品制备法,实现“0”损耗,结合最新的Astral质谱仪突破至数个细胞的检测限度,100个细胞可稳定鉴定出6000+蛋白,实现蛋白的高质量检出,挖掘特殊样本的重要信息,助力疾病机制解析,推动生物医药的发展
极微量蛋白质组通过一步样本制备法实现细胞的裂解、酶解、脱盐一体化,在1管中完成了制备的所有流程,避免了样本转移造成的损失,达到几乎0损耗。为流式分选的细胞、原代培养的细胞、临床穿刺组织、房水等特殊样本提供了解决办法,提高了样本鉴定深度和准确性,为极微量样本的研究提供了重要的工具。
极微量蛋白质组学的实测数据如图所示,基于Astral对细胞样本测试,在100个细胞中实现了6600+的蛋白检出,在1000个细胞中突破至8500+的蛋白检出,实现了低样本量,高检出量,打开了极微量世界的大门。同时,进一步的相关性分析表明样本间具有较高的相关性,数据质量较高。
拜谱生物购入了世界一流的Orbitrap Astral质谱仪,大大提高了数据的检出质量,实现了更高通量、更深覆盖、更高灵敏度、更精准定量和更高稳定性与重现性。同时拜谱生物能够为客户提供全流程服务,包括方案设计、技术指导、高级丰富的生信分析服务等。
质谱仪和丰富的生信分析
样本类型 | 推荐送样量 |
细胞 |
100-1000个 |
动物组织 | 500μg |
体液 | 50μL |