蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析内容:

标准分析

样本比较分析

样本表达分布、相关性分析、PCA分析

全蛋白功能分析(全蛋白GO富集仅模式生物可做)

GOKEGG通路富集分析、亚细胞定位分析

差异蛋白表达分析

差异蛋白表达丰度分析

VENN分析

聚类分析

差异蛋白功能分析

GO富集分析

KEGG通路富集分析

亚细胞定位分析

蛋白功能互作网络(PFIN)分析

多组表达分析(至少三组)

单因素方差分析

k值聚类趋势图(至少3组)

其他内容同两组分析

高级分析:欢迎咨询

筛选biomarker

WGCNA分析(至少53重复)

机器学习和模型构建(至少215重复)

功能分析

代谢通路整体趋势分析

GSEA分析(人,其他物种需定制)

SPIA分析(人、大鼠、小鼠)

Wikipathway通路分析(限定物种见下文)

Reactome通路分析(人、大鼠、小鼠)

个性化分析:欢迎咨询

表达分析

复杂热图(complex heatmap

功能分析

多组比较数据的富集通路气泡图

复杂关系可视化

Circos圈图

桑基图

 

标准流程主要结果展示:

蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

GO注释bar         GO功能富集气泡图        GO功能富集有向无循环图


蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

 

KEGG通路富集柱状图       KEGG通路富集气泡图         亚细胞定位


蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

Venn                       火山图                  聚类分析热图(多组)


蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

k值聚类趋势图              GO功能富集柱状图     KEGG通路富集bar

蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

KEGG通路富集蝴蝶图   蛋白功能互作网络(PFIN)分析图

 

高级分析:

蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

代谢通路整体趋势分析               GSEA分析           SPIA信号通路富集分析

 

 

个性化分析

蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

复杂热图          多组比较数据通路富集气泡图         Circos

蛋白质组学、修饰蛋白质组学分析

Circos图表示蛋白表达热图        桑基图

 



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