宏基因组

随着高通量测序的飞速发展,通过全基因组鸟枪法(whole genome shotgunWGS)对粪便、肠道内容物、土壤、污泥、海水等宏样本进行全基因组测序,获取微生物群落整体生态系统的代谢功能谱和物种组成谱,进一步挖掘响应环境变化的关键生物标志物,阐明微生物群落在生态系统中发挥作用及响应环境变化的根本作用机制。

拜谱生物提供宏基因组测序服务,无需分离纯培养微生物,为环境微生物群落的研究提供了有效工具,适用于评估环境中真实的物种多样性和遗传多样性,挖掘具有应用价值的基因资源,应用于开发新的微生物活性物质。

 

实验流程:

宏基因组 

 

应用方向:

疾病标志物筛查、疾病机制研究、药理及药效分析、环境研究等

 

样本要求:

样本类型

送样量

生物学重复

保存/运输方式

土壤、污泥

3g

3

(临床样本≥10例)

液氮速冻

-80℃保存

干冰运输

胃液/组织液

3ml

粪便/肠道内容物

0.5g

水体/空气滤膜

1

牛奶/酸奶

10ml

 

参考案例:

Zhernakova A, Kurilshikov A, Bonder MJ, et al. Population-based metagenomics analysis reveals markers for gut microbiome composition and diversity. Science. 2016;352(6285):565-569


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