转录组学

转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。转录组谱可以提供什么条件下什么基因表达的信息,并据此推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制。通过这种基于基因表达谱的分子标签,不仅可以辨别细胞的表型归属,还可以用于疾病的诊断。

 

拜谱生物服务内容:

技术方法

数据量

产品特色

测序平台

转录组类

原核生物mRNA转录组

4G

rRNA去除效率高

Illumina Novaseq 6000

动植物mRNA转录组

6G

数握质量高

IncRNA

10G

鉴定IncRNAmRNA

circRNA

10G

剪切位点鉴定

smallRNA

10M Reads

miRNA鉴定

外泌体miRNA

10M Reads

数据质量高

 

应用方向:

生物领域各个研究方向,如农林、微生物、海洋水产、基础医学、临床诊断等

 

样本要求:

样本类型

送样量

生物学重复

保存/运输方式

细胞

10^6

3

(临床样本≥10例)

液氮速冻

-80℃保存

干冰运输

动物/植物组织

0.2g

菌体

5x10^6

血液(抗凝)

2ml

 

项目文章:

1. Chen Z, Ou D, Gu G, et al. Removal of tetracycline from water by catalytic photodegradation combined with the microalga Scenedesmus obliquus and the responses of algal photosynthesis and transcription. J Environ Manage. 2023;326(Pt A):116693.

2. Chen Z, Gu G, Wang Z, et al. Effects of Tetracycline on Scenedesmus obliquus Microalgae Photosynthetic Processes. Int J Mol Sci. 2022;23(18):10544


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