宏基因组测序是指对微生物群体进行高通量测序,分析特定环境中微生物群体基因组成及功能、微生物群体的多样性与丰度,进而分析微生物与环境、微生物与宿主之间的关系,发现具有特定功能的基因。 宏基因组测序是指对微生物群体进行高通量测序,分析特定环境中微生物群体基因组成及功能、微生物群体的多样性与丰度,进而分析微生物与环境、微生物与宿主之间的关系,发现具有特定功能的基因。
技术特点:
宏基因组测序无需分离纯培养微生物,较大扩展了微生物资源的利用,为环境微生物群落的研究提供了有效工具。
宏基因组深度测序可以揭示或估计环境中真实的物种多样性和遗传多样性,挖掘具有应用价值的基因资源,应用于开发新的微生物活性物质。
实验流程:

样本要求:
土壤:10 g;粪便:3-5 g;血液:10 mL;污泥/沉积物:5-10 g;
DNA:总量 ≥ 1 μg、浓度 ≥ 10 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0
测序平台:
Illumina PE100/125/150
数据量:
肠道/粪便 > 3G;水体3-5G;土壤/污泥 > 8G
信息分析:

参考文献:
Guo Z, Zhang J, Wang Z, et al. Intestinal Microbiota Distinguish Gout Patients from Healthy Humans[J]. Scientific reports, 2016, 6.
痛风是由嘌呤代谢失调引起的一种自发性炎症疾病。尿酸是嘌呤代谢的终产物,尿酸盐在关节和关节周围组织中沉积,引起关节严重疼痛,诱发痛风。目前临床检测痛风的两个指标:1) 关节及关节周围组织尿酸盐沉积引发严重疼痛感;2) 血液中高尿酸含量(主要的检测指标)。但尿酸检测敏感度低,目前没有一个精准的诊断方法。目前已经了解到肠道微生物参与嘌呤和尿酸代谢,因此本研究利用微生物构建一种新型诊断痛风的高精准检测指标。

拜谱生物收样表下载:
基因组学送样表(拜谱生物).xls