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全基因组重测序服务

全基因组重测序是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。通过全基因组重测序,研究人员可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)、插入缺失(InDel,Insertion/Deletion)、结构变异(Structure Variation,SV)等变异信息,应用范围涉及临床医药研究、群体遗传学研究、关联分析、进化分析等众多领域。全基因组测序在检测导致疾病发生的潜在基因突变方面更加强大,尤其是SNP检测方面。

 

实验流程:基因组学

全基因组重测序服务

 

分析流程:基因组.

全基因组重测序服务

 

参考文献:

Whole-genome sequence analysis reveals unique SNP profiles to distinguish vaccine and wild-type strains of bovine herpesvirus-1 (BoHV-1)

 

利用IlluminaMiSeq平台对来自宾夕法尼亚和明尼苏达州的18株BoHV-1分离株和5株BoHV-1疫苗株进行了全基因组测序。根据核苷酸多态性(SNPs)将序列聚类为三个组,分别为两个不同的疫苗组和一个不同的田间分离株群。利用这一信息,我们建立了一种新的基于SNP的PCR方法,能够对疫苗和临床菌株进行区分,并有助于准确确定牛BoHV-1的发病率和MLVS与临床疾病的关系。

 

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