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靶向代谢组学

靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术和选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。MRM/SRM技术是基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行碰撞诱导,去除其他离子的干扰,只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集,从而实现对目标代谢分子更为特异、灵敏、准确的分析。

 

靶向定量代谢组学技术路线

靶向代谢组学

靶向代谢组学

 

拜谱生物靶向代谢组学服务内容包括:


 

服务项目
物质名称
种类
植物激素吲哚-3-乙酸、吲哚-3-乙酸甲酯、吲哚-3-丁酸等20种
叶酸类叶酸、同型半胱氨酸、S-腺苷甲硫氨酸、维生素B12等7种
犬尿氨酸犬尿氨酸、犬尿喹啉酸、喹啉酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、3-羟基犬尿氨酸等7种
脂溶性维生素Vitamin_A1(Retinol) 、Vitamin D2 、Vitamin D3 、25-OH_Vitamin_D2 等7种
水溶性维生素Vitamin_C (Ascorbic_acid) 、Vitamin_B1 (Thiamine) 、Vitamin_B2 (Riboflavin)、Vitamin_B3 (Nicotinamide)、Vitamin_B5 (Pantothenic_acid)等12种
靶向脂质FFA、LPA、LPC、LPE、LPI、LPG等500种以上
P200代谢物乙酰化赖氨酸、D-生物素、单磷酸胞苷、硫胺素焦磷酸、乙酰亮氨酸、羧基丁酸、硫胺素一磷酸盐等200种
短链脂肪酸-GCMS乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、戊酸、己酸7种
中长链脂肪酸-GCMS丁酸、辛酸、十三烷酸、γ-亚麻酸、二十碳三烯酸等37种
胆汁酸-GCMS胆酸、别胆石酸、3β-熊去氧胆酸、正胆酸等42种
花生四烯酸花生四烯酸、二十二碳六烯酸、血栓烷B2、前列腺素F2α、白细胞三烯D4等15种
类胡萝卜素a-胡萝卜素、β-胡萝卜素、叶黄素等16
类黄酮芹菜素、芹菜素4`-O-鼠李糖苷、白杨素、木犀草素、樱花素、木犀草素 O-芥子酰己糖苷、麦黄酮5-O-乙酰基己糖苷、儿茶素、表儿茶素,原儿茶酸,表没食子酸儿茶素等410种以上
花青素锦葵色素3-O-葡糖普,矢车菊素,花翠素,花翠素3-O-葡萄糖苷,天竺葵素,天竺葵色素苷等35种以上
植物次生代谢黄酮类、花青素、酚胺类、植物激素类、生物碱、萜类、羟基肉贵酰、色胺类、奎宁酸类、儿茶素类、维生素、脂质、糖类、有机酸、氨基酸、核苷酸、其他1610种以上
个性化靶向代谢根据客户需求定制


 

能量代谢标准物XIC图谱

靶向代谢组学

靶向代谢组学



能量代谢物KEGG通路图

靶向代谢组学

 

能量代谢:本检测方法覆盖了三羧酸循环、糖酵解途径和氧化磷酸化过程中的近30个重要代谢物

  

代谢组学适用范围

体液:血清、血浆、尿液、唾液、膝盖滑液、脑脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、淋巴液、胆汁等

组织:各种动物组织和植物组织

细胞:细胞及细胞培养液等

微生物:大肠杆菌、链球菌等

其他:粪便、食糜、肠道内容物等

 

应用领域:

非靶向代谢物组学结果的验证

代谢相关生理、病理研究

发酵工艺研究

食品科学与营养学研究

 

拜谱生物优势:

1.  测试种类广:购买了大批同位素标准品,建立了多种靶向代谢定量的实验方法。

2.  项目周期短:通过流程优化,整个项目最快可以30个工作日完成,比市场平均周期短10天以上!

3.售后服务到位:售后服务团队具有丰富的代谢组实验经验,更能理解客户需求!

 

样品要求

样品类型

推荐样本量

预处理及保存

组织

>200mg

液氮速冻, -80°C保存。  

尿液

>0.3ml

5000×g 4°C 离心30-60min,取上清, -80°C保存。

血清/血浆

>0.3ml

收集好的血清/血浆液氮速冻,-80°C保存。

脑脊液、羊水、胆汁等体液

>0.3ml

1000g-2000g 4°C 离心10min,(或使用0.22μm滤膜过滤),取上清,-80°C保存。

悬浮细胞

>107

离心收集细胞后液氮速冻后-80℃保存。

贴壁细胞

>107

培养好的贴壁细胞保存在1.5ml离心管中,液氮速冻后-80℃保存

细胞上清液

>10ml

1000g 4℃条件下离心3分钟,取上清,-80°C保存。

 

靶向代谢组学建议样本建议样本重复数量如下

动物样本(各种组织、血浆)

每组 ≥ 6个重复

植物、微生物样本(叶片、根组织)

每组 ≥  3个重复

细胞样本

每组 ≥ 3个重复

临床样本(血清、尿液、各种组织等)

每组 ≥ 10例

 

应用案例:

1.   Wei R, Li G, et al. High-throughput and multiplexed LC/MS/MRM method for targeted Metabolomics. Anal Chem. 2010; 82(13):5527-33.

2.   Roberts LD, Souza AL, et al. Targeted metabolomics. Curr Protoc Mol Biol. 2012; Chapter 30:Unit 30.2.1-24.



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