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非靶向代谢组学

非靶向代谢组学全面检测生物体整个代谢组 (metabolome),重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢特征(metabolic features),并鉴定代谢特征的化学结构,进而解释所发现的代谢物及其代谢通路与生命过程或生命状态之间的关联。非靶向代谢组学技术一次实验能够检测大于10,000 个代谢特征,因而有利于发现新的代谢物和新的代谢通路,对于发展用于疾病诊断的生物标志物和疾病病理研究十分重要。

 

技术流程:

非靶向代谢组学


非靶向代谢组学

 

非靶向代谢组数据分析:PCA、OPLS-DA、KEGG等

 

非靶向代谢组学

非靶向代谢组学

非靶向代谢组学

 

技术优势

 

应用范围广:液相色谱可以分离无挥发性和未衍生化的代谢物。因此,LC/MS可以分离和分析的化合物种类范围更广。而GC-MS可以弥补LC-MS无法检测的部分代谢物。

前处理简单:优势主要表现在样品制备和前处理简单、实验重复性好。

高分辨率和稳定性:我们拥有稳定的质谱检测系统,且稳定性较好;检测样品时设置QC可以充分保证实验结果的准确性和可重复性。

 

应用领域

 

1.疾病诊断和发病机制研究

2.药物毒理学、新药筛选、药物安全评价

3.中药研究及中医结合

4.植物和农业研究

5.微生物与发酵研究

6.食品健康、食品安全的研究

 

拜谱生物优势:

1.  测试质量高:采用高精度Q-TOF仪器测试,可以得到更精确的代谢物二级质谱图。

2.  项目周期短:通过流程优化,整个项目最快可以30个工作日完成,比市场平均周期短10天以上!

3.  售后服务到位:售后服务团队具有丰富的代谢组实验经验,更能理解客户需求!

 

                                                                  

                                                                                        样品要求

样品类型

推荐样本量

预处理及保存

组织

>200mg

液氮速冻, -80°C保存。

尿液

>0.3ml

5000×g 4°C 离心30-60min,取上清, -80°C保存。

血清/血浆

>0.3ml

收集好的血清/血浆液氮速冻,-80°C保存。

脑脊液、羊水、胆汁等体液

>0.3ml

1000g-2000g 4°C 离心10min,(或使用0.22μm滤膜过滤),取上清,-80°C保存。

悬浮细胞

>107

离心收集细胞后液氮速冻后-80℃保存。

贴壁细胞

>107

培养好的贴壁细胞保存在1.5ml离心管中,液氮速冻后-80℃保存

细胞上清液

>10ml

1000g 4℃条件下离心3分钟,取上清,-80°C保存。

  

 

非靶向代谢组学建议样本重复数量如下

 

动物样本(各种组织、血浆)

每组 ≥ 10个重复

植物、微生物样本(叶片、根组织)

每组 ≥  8个重复

细胞样本

每组 ≥ 6个重复

临床样本(血清、尿液、各种组织等)

每组 ≥ 20例

 

 

应用案例

1.Norskov NP, Hedemann MS, et al. Multicompartmental nontargeted LC-MS metabolomics: explorative study on the metabolic responses of rye fiber versus refined wheat fiber intake in plasma and urine of hypercholesterolemic pigs. JProteome Res. 2013; 12(6): 2818-32.

2.Huang Q, Tan Y, et al. Metabolic characterization of hepatocellular carcinoma using nontargeted tissue metabolomics. Cancer Res. 2013; 73(16): 4992-5002.

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