timsTOF Pro平台加持，开启高速度&高灵敏度&高通量&高覆盖度蛋白质组学
Bruker timsTOF Pro质谱平台
价格优惠：相比3D蛋白质组学，价格仅高500元！
结果丰富：完善的质控与分析流程，精确匹配定制个性化分析报告！
售后完善：专业小组指导数据挖掘，可指导文章写作思路和方法校对！
产品全面：4D-label free、4D-DIA、4D-PRM、4D-修饰组学，近20种产品类型，在国内相当丰富！
完善的质控与分析流程，精确匹配定制个性化分析报告！
标准分析主要结果展示
高级分析主要结果展示（功能上下调分析）
DA-score GSEA SPIA
个性化分析主要结果展示（复杂关系可视化）
复杂热图 多比较组气泡图 桑基图 circos圈图
拜谱生物20种4D产品，相当丰富！
4D-label free、4D-DIA、4D-PRM、4D-修饰组学！
拜谱生物4D--蛋白质组学产品概览
| 产品类型 | 采集模式 | 应用范围 |
4D -- 蛋 白 质 组 学 | 4D-label free | DDA+PASEF | 适于各类样本，尤其是微量样品：细胞、血液、石蜡切片等 |
4D-DIA | DIA+PASEF | 适于大规模样本研究：临床大对列样本等 |
4D-PRM | PRM+PASEF | 非靶蛋白组学数据可靠性验证，biomarker或功能验证 |
4D -- 翻 译 后 修 饰 蛋 白 质 组 学 | 4D-棕榈酰化 | DDA+PASEF | 癌症、心血管疾病、神经科学、病原体和寄生虫；植物生长和抗逆；食品安全检测 |
4D-亚硝基化 |
4D-氧化修饰 |
4D-广谱磷酸化 | 响应胁迫：信号转导、细胞周期、生长发育以及癌症机理等 |
4D-酪氨酸磷酸化 |
4D-甲基化 | 表观遗传：癌症、衰老、老年痴呆等疾病研究 |
4D-乙酰化 | 修饰“代谢酶”，调节代谢通路，在代谢疾病中普遍存在 |
4D-泛素化 | 真核生物胁迫响应：癌症、神经退行性疾病等研究 |
4D-糖基化 | 参与免疫应答、细胞凋亡及各种发病机理等生物学过程 |
4D-丙酰化 | 表观遗传、心血管疾病、代谢疾病、肿瘤、结核病、炎症、过敏性皮炎 |
4D-丙二酰化 |
4D-戊二酰化 |
4D-琥珀酰化 |
4D-磷酸化PRM | PRM+PASEF | 非靶蛋白组学数据可靠性验证，biomarker或功能验证 |
4D-乙酰化PRM |
4D-泛素化PRM |
送样指导
样品类型 | 4D--蛋白质组学 | 4D-翻译后修饰蛋白质组学 |
动物组织 | ≥10mg | ≥50mg |
植物组织 | ≥100mg | ≥250mg |
细胞样品 | ≥3×10^6 | ≥1×10^7 |
血液、脑脊液等体液 | ≥50uL | 体液不建议做修饰组学，推荐做血浆外泌体修饰组学 |
尿液 | ≥50mL |
微生物类（菌类） | ≥50mg | ≥150mg |
... | ... | ... |
基于timsTOF Pro质谱平台，4D-蛋白质组学的核心技术
双TIMS分析器：捕集离子淌度谱 (Trapped Ion Mobility Spectrometry, TIMS)
扫描模式：同步累积连续碎裂 (Parallel Accumulation Serial Fragmentation, PASEF)
TIMS分析器增加了离子淌度（Ion mobility）分离维度
第四维度离子淌度分离原理
离子淌度是代表离子迁移速率特征的物理量。基于离子的形状和大小，不同肽段离子与气流的碰撞截面积（Collision cross section，CCS）不同。离子CCS小，迁移速率快；离子CCS大，迁移速率慢，使得m/z无法分离的肽段通过离子淌度差异得以准确高效分离。
Meier F, et al., Online Parallel Accumulation-Serial Fragmentation (PASEF) with a Novel Trapped Ion Mobility Mass Spectrometer. Mol Cell Proteomics. 2018.
双TIMS & PASEF分析流程
色谱分离→TIMS1累积→TIMS2淌度分离→同步四极杆质量过滤器→高速碰撞池碎裂→飞行时间质量分析器
PASEF技术：同步累积连续碎裂
肽段离子在TIMS1中累积并聚焦，在TIMS2中进行淌度分离并逐步释放，经四极杆选择后在碰撞池中碎裂。当肽段离子在TIMS2中分离释放时，TIMS1会同步累积后续离子，称为PASEF。PASEF技术使离子累积、淌度分离、四极杆选择能同步进行，实现近乎100%的离子利用率。
实验流程
Meier F, et al., diaPASEF: parallel accumulation-serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.
应用场景与技术优势
1.常规定量蛋白质组学
近乎100%的离子利用率，更高的鉴定深度
扫描速度超过100Hz MS/MS，可对低丰度肽段多次选择并碎裂，提高低丰度肽段的谱图质量
2.微量样品/单细胞蛋白质组学
极高的灵敏度，更少的进样量
双TIMS与PASEF技术加持，灵 敏度全面提升，蛋白量仅需ng级
3.临床大队列蛋白质组学
速度更快，重复性更好，稳定性更强
速度提升使上机时长缩短，通量更高，有效降低空缺值使重复性更好，且仪器性能稳定
4.翻译后修饰（PTM）蛋白质组学
更强的分离能力，更高的准确度
离子淌度CCS分离有效解决位点异构问题，使修饰位点鉴定更可靠
案例分析
案例一：新冠肺炎早期免疫抑制研究
基于4D--DIA蛋白质组学技术，发现新冠患者感染早期表现出免疫抑制。进一步分析中度和重度患者后，首次提出“两阶段”的发病机制。该研究为了解临床症状的分子机制以及后期治疗策略提供了基础。
4D--DIA蛋白组研究思路 新冠肺炎发病机制的“两阶段”模型
Tian W, et al., 2020, Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. (nature communications, IF=14.9)
拜谱生物收样表下载：
蛋白质组学送样表（拜谱生物）