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PRM定量蛋白质组学

PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,是对传统质谱定量技术SRM/MRM的升级版,该技术能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。


PRM定量蛋白质组学 


PRM技术基于高分辨、高精度质谱(如Orbitrap系列),首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力,在一级质谱中(Q1)选择性地检测目标肽段的母离子信息;随后在collision cell中对母离子进行碎裂;最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。 

 

技术特点:       

 

相比于传统的SRM/MRM技术,PRM技术将采集二级信息所用的四级杆质量分析器替换为更高分辨、更高质量精度的分析器,实现了从目标离子对检测到全部目标离子碎片检测的转化。因此,PRM技术不仅具有SRM/MRM的靶向定量分析能力,还同时具备了定性能力。

 

其在定量分析中的优势还体现在:

 

(1)质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;

(2)对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,更容易进行方法学建立;

(3)更宽的线性范围:增加至5-6个数量级。   

 

PRM应用范围:       

 

1、可以对iTRAQ/TMT标记定量差异蛋白进行验证;

2、可以对LFQ非标定量差异蛋白进行验证;

3、可以对肽段和蛋白质进行绝对定量分析;

4、可以对已经建立或寻找到的Biomarker蛋白进行定量分析;

5、可以特异性地对蛋白的修饰位点(磷酸化、乙酰化等)进行定量分析;

6、可以特异性地某通路蛋白进行定量分析  


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