PRM定量蛋白质组学

PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,是对传统质谱定量技术SRM/MRM的升级版,该技术能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。PRM技术基于高分辨、高精度质谱(如Orbitrap系列),首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力,在一级质谱中(Q1)选择性地检测目标肽段的母离子信息;随后在collision cell中对母离子进行碎裂;最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。


原理/实验流程图:

PRM定量蛋白质组学 

 

技术特色:       

(1)质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;

(2)对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,更容易进行方法学建立;

(3)更宽的线性范围:增加至5-6个数量级。   

 

与Western Blotting比较:       

PRM定量蛋白质组学


应用方向:

  1. 差异蛋白验证

  2. 目标蛋白质/肽段定量分析

  3. 生物标志物靶向检测

  4. 蛋白修饰位点靶向检测

  5. 生物通路特异蛋白靶向检测


样品要求  

样品类型

样品要求

植物叶片

湿重≥0.2g

植物根茎、木质郁韧皮部等

温重≥5g

细胞样品

细胞量1x107

组织样品

人、动物、微生物湿重≥50mg

体液样品

血清、血浆体积≥100μl脑脊液≥200μl,尿液≥8ml



拜谱生物收样表下载:定量N糖基化蛋白质组分析蛋白质组学送样表(拜谱生物)


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