全局组蛋白修饰定量分析

组蛋白修饰(Histone Modification)是表观遗传学中最为重要和多样的一种调控方式,广泛参与发育和器官形成、肿瘤、神经疾病、衰老、遗传病等生理病理过程;且其作为药物靶标,相关酶抑制剂药物已在临床上应用。拜谱生物全局组蛋白修饰定量分析,是国内唯一兼顾高通量与多重修饰crosstalk的,可以同时对全局组蛋白的乙酰化、一甲基化、二甲基化、三甲基化等多种修饰类型进行鉴定,一次检测可鉴定到200+修饰条目,提供组蛋白修饰位点、修饰类型、定量强度等系统、详实、多样化的结果信息助力科研工作者破译表观遗传密码。

 

实验流程:

全局组蛋白修饰定量分析 

 

产品特色:

1、全局无偏高通量,多重修饰crosstalk国内唯一兼顾高通量与多重修饰crosstalk,一次可检测到200+个修饰条目,包括一甲基化、二甲基化、三甲基化、乙酰化等。

2、定性+定量,发现新的位点,比较差异变量全局无偏且能发现新的、未知的组蛋白修饰位点,可获得不同比较组别的组蛋白修饰水平差异,为进一步筛选标志物和解析机制机理奠定基础。

3、多维度直观比较,分析内容多样化:提供完善、详实的系统性生信分析及多样化的结果呈现

 

应用方向:

组蛋白修饰介导的基因表达调控作用于几乎所有的生物过程,因此,从横向研究方向来看,组蛋白修饰广泛参与发育和器官形成、肿瘤、神经疾病、衰老、遗传病等生理病理过程,拜谱生物全局蛋白修饰定量分析可应用于以上多种场景。从纵向研究机制来看,组蛋白修饰是受相关酶介导的动态可逆反应,相关酶的功能、组织及位点特异性、发掘药物靶标、药物治疗机制等研究都是拜谱生物全局蛋白修饰定量分析的潜在应用方向。

1、生理机制研究:生长发育、器官形成等

2、病理研究:神经疾病、衰老、遗传病等疾病发生发展

3、药物靶标:组蛋白修饰具有动态和可逆的特性,是理想的药物靶标

4、药物治疗机制:癌症药物HDAC(组蛋白去乙酰化酶抑制剂)等调控机制

5、健康管理:饮食对表观遗传的影响

 

样本要求:

人和小鼠的组织和细胞样品,其他物种请另询。

组织建议送样量100mg;细胞建议送样量≥7×10^7个。


案例

1、环境因素对表观遗传的影响

文献名称:Diet-Microbiota Interactions Mediate Global Epigenetic Programming in Multiple Host Tissues

发表期刊:Molecular CellIF=19.328

发表时间:2016

技术方法:组蛋白乙酰化和甲基化修饰组学

样品类型:肝、脂肪、近侧结肠

研究内容:该研究发现正常饮食与吃“西餐”的小鼠肠道菌群不同,西餐限制了肠菌短链脂肪酸(SCFA)的产生。进一步运用全局组蛋白乙酰化和甲基化修饰组学,发现西餐改变了宿主肝、脂肪、近侧结肠的组蛋白修饰水平,并导致肝脏基因表达的功能相关改变,而给无菌小鼠补充SCFA可以恢复表观遗传学特征。这些发现对理解饮食-肠道菌-代谢物-宿主靶器官-组蛋白表观遗传修饰-宿主健康之间复杂的调控作用具有深远意义。

全局组蛋白修饰定量分析

(图源:Nativio R, et al., Nat Genet, 2020

 

参考文献:

[1] Krautkramer KA, Kreznar JH, Romano KA, et al. Diet-Microbiota Interactions Mediate Global Epigenetic Programming in Multiple Host Tissues. Mol Cell. 2016;64(5):982-992. doi:10.1016/j.molcel.2016.10.025.


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