超高深度DIA·植物磷酸化修饰组

 超高深度DIA·植物磷酸化修饰组

磷酸化修饰是生物体内最广泛存在的PTM,迅速响应的可逆磷酸化是蛋白活性的分子开关,调节着植物生长分化、细胞间通信、环境响应等生命全过程。据报道,人体内有518种激酶,而植物中有1100多种,因此研究植物磷酸化是尤为必要的。拜谱生物超高深度DIA·植物磷酸化修饰组,最高鉴定位点数达50000+个,数据挖掘空间大,并提供磷酸化位点信息、差异磷酸化肽段、motif分析、功能通路富集、蛋白互作网络图等一站式分析服务,全面解析植物磷酸化信号转导网络调控机制

 

技术原理与实验流程:

超高深度DIA·植物磷酸化修饰组 

 

产品特色:

1、革命性样本制备方案:全球独创植物样品制备及磷酸化富集技术

2、样本间重复性高:DIA全息扫描,实现超大规模样本集检测

3、所需样本量更少:新鲜植物组织最低叶片类仅需100 mg

4、数据挖掘空间大:5000+个差异位点,生信分析效率高

 

应用方向:

拜谱生物超高深度DIA·植物磷酸化修饰组是植物生长发育、胁迫应答、信号转导、激素调控、群体性状、图谱构建等的研究利器。

1、植物生长发育:幼苗生长、种子果实发育、物质合成、激素调控等

2胁迫应答:干旱胁迫、金属胁迫、生物胁迫等

3、信号转导:识别转导、转录调控、代谢调节等过程

4、其他:群体性状、图谱构建等

 

样本要求:

模式植物如拟南芥、水稻、烟草等,农作物如大豆、玉米、藜麦、棉花等,果蔬植物如番茄、柑橘等,药用植物如丹参、苜蓿等的新鲜组织,最低叶片类100 mg


实测数据:

更深覆盖度:拜谱生物与中科院逆境生物学研究中心合作数据实测50000+个磷酸化位点,20000个磷酸化蛋白肽段,5000+个差异位点,单针检测到24k-32k磷酸化位点,突破记录。

超高深度DIA·植物磷酸化修饰组

超高深度DIA·植物磷酸化修饰组


超高稳定:DIA全息扫描,实现超大规模样本集检测。MS1/MS2丰度趋势一致,数据缺失值仅1.6%

超高深度DIA·植物磷酸化修饰组

超高深度DIA·植物磷酸化修饰组



参考案例:

1Wang P, Zhao Y, Li Z, et al. Reciprocal Regulation of the TOR Kinase and ABA Receptor Balances Plant Growth and Stress Response. Mol Cell. 2018;69(1):100-112.e6. doi:10.1016/j.molcel.2017.12.002.

2Zander M, Lewsey MG, Clark NM, et al. Integrated multi-omics framework of the plant response to jasmonic acid [published correction appears in Nat Plants. 2020 Aug;6(8):1065]. Nat Plants. 2020;6(3):290-302. doi:10.1038/s41477-020-0605-7.

3Mergner J, Frejno M, List M, et al. Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome. Nature. 2020;579(7799):409-414. doi:10.1038/s41586-020-2094-2


拜谱生物收样表下载:定量N糖基化蛋白质组分析蛋白质组学送样表(拜谱生物)


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