棕榈酰化修饰(palmitoylation或S-palmitoylation或S-acylation)根据其连接方式可以分为S-棕榈酰化、N-棕榈酰化和O-棕榈酰化。其中,S-棕榈酰化是指含有16个碳原子的饱和棕榈酸和蛋白的半胱氨酸残基的S端结合,形成不稳定的硫酯键,这种棕榈酰化具有可逆性,可在时间和空间上调节蛋白质的功能,因此棕榈酰化修饰通常是指S-棕榈酰化。棕榈酰化增加了蛋白质的疏水性,增强了蛋白与细胞膜的亲和性,将胞浆蛋白瞬时靶向到细胞膜上,因而可用于研究蛋白质的转运和定位。此外,棕榈酰化将蛋白质束缚到膜微域中,例如脂筏,从而调节蛋白质的活性、稳定性和多蛋白质复合物的形成。
技术路线

在所有脂质化修饰中,棕榈酰化修饰作用极为普遍,影响约20%的蛋白质组。然而由于一般的棕榈酰蛋白含量低,高特异性富集棕榈酰蛋白困难以及完整的棕榈酰肽的高疏水性等相关技术挑战,尚未进行充分研究。
相关图片展示

前列腺癌来源的细胞外囊泡富含棕榈酰化蛋白(Javier Mariscal et al.)

在拟南芥中的棕榈酰化修饰,促进并定义蛋白质的膜定位(Piers A. Hemsley and Claire S. Grierson)
文献案例
1. Javier Mariscal et al., 2020, Comprehensive palmitoyl-proteomic analysis identifies distinct protein signatures for large and small cancer-derived extracellular vesicles. (IF=14.976, Q1, JOURNAL OF EXTRACELLULAR VESICLES) 棕榈酰化蛋白组综合解析大小不同的癌症来源的细胞外囊泡的独特蛋白质特征
2. Michael X. Henderson et al., 2015, Neuronal ceroid lipofuscinosis with DNAJC5/CSPα mutation has PPT1 pathology and exhibits aberrant protein palmitoylation. (IF=18.174, Q1, Acta Neuropathologica) DNAJC5 /CSPα突变的神经元蜡样脂褐质沉积症具有PPT1病理并且表现出异常的蛋白棕榈酰化
3. Yesica R Nievas et al., 2018, Protein Palmitoylation Plays an Important Role in Trichomonas vaginalis Adherence. (IF=4.828, Q1, Molecular & Cellular Proteomics) 蛋白棕榈酰化在阴道毛滴虫粘附中起重要作用
4. Anita L. Pinner et al., 2016, Decreased protein S-palmitoylation in dorsolateral prefrontal cortex in schizophrenia. (IF=4.569, Q1, Schizophrenia Research) 精神分裂症患者背外侧前额叶皮层的s -棕榈酰化蛋白减少
送样指导
样本类型(固体) | 送样量 | 样本类型(液体) | 送样量 |
常规动物组织 | ≥50 mg | 血清/血浆 | ≥1 mL |
柔软组织(叶/花等) | ≥300 mg | 乳汁 | ≥3 mL |
细菌菌体 | ≥100 mg | 尿液 | ≥30 mL |
真菌菌体 | ≥5 g | 其他体液 | ≥300 μL |
细胞 | ≥6*10^7 | 分泌蛋白(细胞分泌液/脑组织分泌液) | ≥10 mL |
拜谱生物收样表下载:
蛋白质组学送样表(拜谱生物)