Data independent acquisition proteomic analysis can discriminate between actinic keratosis,Bowen’s disease and cutaneous squamous cell carcinoma

期刊：Journalof Investigative Dermatology

实验背景

光化性角化病(AK)、鲍文氏病(BD)和皮肤鳞状细胞癌(cSCC)是异质性角化细胞的皮肤病变(KSL)。为了对这类皮肤肿瘤进行精准治疗，需要将这类疾病进行准确的分型

实验目的

利用SWATH-MS蛋白组学的方法，寻找生物标志物，以实现对皮肤疾病的准确分析。

技术路线(实验方案)

实验结果

1）共鉴定到3574个蛋白质，差异分析，对于光化性角化病(AK)、鲍文氏病(BD)和皮肤鳞状细胞癌(cSCC)分别有19、5和6个独有的差异蛋白；

2）在不同程度的cSCC肿瘤分化中，分别有118、230和17个蛋白可以作为高分化（WD）、中等分化（MD）和低分化（PD）的cSCC标志物；

3）生物信息学分析显示，AK和cSCC病变与细胞凋亡减少有关，BD病变与DNA损伤修复通路的过表达有关。FGFR2选择性剪接、Rho GTPase信号转导和RNA代谢蛋白的差异表达与cSCC肿瘤分化水平有关；

部分结果展示