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有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究

有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究

Proteomics of Uterosacral Ligament Connective Tissue from Women with and without Pelvic Organ Prolapse

研究对象:有无盆腔器官脱垂的妇女

样本类型:子宫骶骨韧带结缔组织

组别设置:4例盆腔器官脱垂POP患者和4例对照

研究方法:iTRAQ定量蛋白质组学

期刊: Proteomics – Clinical Applications

影响因子:2.489


有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究





研究背景



子宫骶骨韧带损伤是子宫和阴道脱垂的重要原因,POP是一种常见的、昂贵的、使人衰弱的疾病,对许多妇女的生活质量产生了负面影响。来自浙江大学的研究人员,使用蛋白质组学分析发现盆腔器官脱垂(POP)和未发生盆腔器官脱垂的女性子宫骶骨韧带中的差异表达蛋白(DEPs),并分析其与POP发病机制的细胞机制之间的关系,一共有88显著差异蛋白质。其中,纤维调素、胶原蛋白(XIV)链、钙蛋白-1、肌腱蛋白、半乳糖凝集素-1在POP的病因学中有可能发挥关键的作用。其研究成果发表在2019年7月的Proteomics – Clinical Applications杂志上(IF=2.489)





研究思路




有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究





研究结果


1
结缔组织的蛋白质组学



  • 两个比较组的年龄,更年期年龄和身体质量指数是相似的,使用蛋白质组学分析,在子宫骶骨韧带结缔组织中确定了1789个高可信度的非冗余蛋白质;

  • 确定了88个差异表达的蛋白质(FC≥1.2-fold或FC≤0.83, p < 0.05),包含30个上调蛋白质和58个下调蛋白质,这些差异蛋白质通过层次聚类分析进行可视化展示(图1A)。

有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究

图 1    A)显著差异蛋白的层次聚类分析   B)3个差异表达蛋白的WB证实



2
Western Blot证实


  • 对蛋白质组学的结果,选择感兴趣的3个重点差异蛋白质使用WB进行证实,WB证实了FMOD,MYL6和M1F的表达在POP的子宫骶骨是有显著变化的,并且与蛋白组学的结果是吻合的;

  • 几个差异蛋白是与结缔组织功能相关,进一步分析了这些与结缔组织功能相关的蛋白质。


有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究

图2 IPA通路分析与“结缔组织障碍”相关的差异表达蛋白的下游效应分析



3
疾病和功能分析



  • 88个差异表达蛋白质进行IPA路径分析,这些差异蛋白主要聚集在“疾病和障碍”,“生理系统的发育和功能”;

  • 差异蛋白与“疾病和障碍”(p<0.05< span=''>)显著相关的路径有28种,与“生理系统发育和功能”显著相关的路径有27种

  • 对基因列表的“疾病与障碍”分析,有7个差异表达蛋白与“结缔组织障碍”相关,基于对“生理系统发育和功能”分析,有14个差异表达蛋白与“结缔组织功能”相关。



4
网络分析



实验发现的蛋白质和IPA数据库蛋白质构建了假设网络,最佳匹配网络涉及17个差异表达蛋白质。它与IPA功能有关,包括“药物代谢”、“蛋白质合成”和“小分子生物化学”。


有无盆腔器官脱垂的妇女子宫骶骨韧带结缔组织的蛋白质组学研究

图3 通过IPA通路分析与“结缔组织功能”相关的特异性差异表达蛋白的下游效应分析





本次研究的亮点



蛋白质组学补充了其他功能和基因组方法,以了解疾病的生理学和病理生理学。本研究通过IPA进一步分析了差异表达蛋白可能的下游和上游调节因子,为POP的发病机制提供了有用的见解。有至少6种先前与POP的发病机制没有关联的蛋白,其生物学功能表明与该疾病的关系被确定,这些结果可能有助于进一步了解POP的病理生理机制。




拜谱生物研发人员具备10年以上蛋白组学、修饰蛋白质组学、代谢组学、转录组学、基因组学等科研服务经验,提供各类样本分析方案与实验设计方案。已合作发表多篇高水平项目文章,欢迎来电咨询。




                                                                                                 

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