锦囊妙计,热点收割机|拜谱生物2023年组学特色产品及方案推荐!


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·PART-ONE·



蛋白组产品




超高深度血液蛋白质组

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血液是最常见的样本类型之一,血液中蛋白质水平的变化是疾病临床诊断的重要指标。2023年血液组学研究多发表在Nature、Science、Blood等顶刊,特别是年末UK Biobank大队列血液蛋白组学的Nature文章三连发,引发了广大学者的关注。基于质谱的血液蛋白质组学正逐渐成为血液蛋白质研究的重要工具,在肿瘤标志物筛洗、免疫疾病、心血管代谢疾病等领域发挥着不可替代的作用。2023年,拜谱生物出全新的超高深度血液蛋白质组系列产品,采用自研血液中低丰度富集试剂盒(BP-MagBeads Kit),结合最新Orbitrap Astral质谱仪,推出超高深度血液蛋白质组3款系列产品:实现4000+蛋白鉴定深度的DB4000、5000+蛋白鉴定深度的DB5000、7000+蛋白鉴定深度的DB7000,助力深度挖掘血液信息,推动疾病的治疗和发展。

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产品特点:


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 拜谱自主研发血液中低丰度富集试剂盒(BP-MagBeads Kit),创新纳米材料富集,中低丰度蛋白鉴定量提升10倍左右。


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全新一代Oribtrap Astral质谱平台,更高通量、更深覆盖、更高灵敏度、更精准定量、更高稳定性与重现性。


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超高深度血液蛋白质组系列产品可分别实现4000+、5000+、7000+蛋白鉴定深度、中低丰度蛋白覆盖度95%。








“DIA-Ultra”蛋白组

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数据非依赖性采集(DIA)定量技术,将整个质谱的扫描质量范围分为若干窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,采集全部离子信息。DIA技术因其全局无偏、重复性、稳定性高的性质,已成为蛋白质组学领域最火的技术之一,可以对复杂的、大规模的蛋白样本进行高分辨率和高灵敏度的精确定量鉴定。拜谱生物基于丰富的DIA蛋白组技术积累和项目经验,结合赛默飞全新一代Astral质谱仪,推出创新性“DIA-Ultra”蛋白质组产品,实现优异的稳定性和重现性,达到蛋白质定量万级检测深度,为您打造稳定可靠的蛋白质定量分析方案。

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产品特点:


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优异的稳定性与重现性


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蛋白定量万级检测深度


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全局无偏扫描、适合大队列样本检测








超高深度FFPE蛋白质组

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在过去的十几年里,分子病理学的重大突破之一是从FFPE的临床组织中有效提取生物分子包括DNA、RNA和蛋白质。FFPE样本一般会记录患者的诊断、治疗和后续随访信息,临床信息丰富,可以帮助理解疾病的发展机制和预后策略。除此之外,它的处理和存储的成本较低,常温下即可保存,因此在肿瘤研究中应用广泛,可用于研究癌细胞的突变、蛋白质表达和分子异质性等方面。近年来随着质谱技术的蓬勃发展,FFPE样本的科研价值得到充分开发,结合蛋白组学研究发表的文献数量急速上涨。拜谱生物对FFPE样本的切片脱蜡、蛋白提取、肽段酶解、上机测试等全流程进行优化,并结合全新一代Astral质谱平台高稳定性、高灵敏度、高通量、高深度的优势,在大队列样本中稳定实现8000+蛋白数量的检出,开启了“超高深度FFPE蛋白质组”鉴定新纪元!

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产品特点:


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 主流脱蜡策略+革命性质谱平台


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高鉴定深度+高稳定性


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严格质控+特色生信分析








微量蛋白质组

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基于质谱的蛋白质组学方法能够实现对蛋白质的定性和定量,以及复杂样本中的翻译后修饰测定,但是,常规的蛋白质组学需要大量样本,比如细胞需要5×10⁶,组织需要30mg。对于一些特殊的样本类型,比如流式分选的细胞、原代培养细胞,以及一些临床穿刺组织、玻璃体、房水等,这些样品类型珍贵、不易获取、样本量少,往往达不到常规蛋白质组学对于样本量的要求。为了解决这一难题,拜谱生物全新推出微量蛋白质组,使用SP3技术结合全新一代Orbitrap Astral质谱平台,起始细胞数低至200个,可实现高深度蛋白检测,既能满足鉴定深度又能兼顾稳定性,尤适用于大队列样品的分析。

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产品特点:


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 主流富集方法+革命性质谱策略,实现微量、珍稀样本的蛋白质检测


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 磁珠无偏好富集蛋白组分,去除高丰度干扰,突破蛋白检测深度


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DIA思维全息扫描,高稳定性,高重复性,适合大队列样品分析











02

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·PART-TWO·



      修饰蛋白质组产品




半胱氨酸修饰蛋白质组

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蛋白半胱氨酸残基上的游离巯基容易受到各种修饰的影响,其中氧化水平影响体内的半胱氨酸氧化还原状态,引起不同的细胞反应。与常规蛋白质修饰组学相比,半胱氨酸的多种修饰是该领域的研究热点,已有研究少,更具新颖性,发表文章更容易。拜谱生物半胱氨酸修饰蛋白质组已积累丰富项目经验,早先推出的亚硝基化修饰组产品成功助力Nature文章发表。在此基础上,拜谱生物专业研发团队再做突破,全新推出半胱氨酸修饰蛋白质组产品,实现棕榈酰化、亚硝基化、谷胱甘肽化、次磺酸化、硫巯基化、Total 氧化还原、游离巯基蛋白组检测与分析,助力剖析半胱氨酸修饰的分子机制和调控作用,解析疾病相关分子机制等。

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产品特点:


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 更丰富的半胱氨酸修饰家族:7种


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 更合适的富集方案:生物素标记


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更严谨的实验设计:每例样本设置对照组








糖蛋白修饰组学

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蛋白质的糖基化是一种重要的翻译后修饰,它涉及多种生物途径和分子功能。近些年,关于蛋白质糖基化修饰的高质量研究论文层出不穷,越来越多的证据表明糖基化修饰与生理病理功能密切相关。同时,在国家自然科学基金资助的项目上,糖基化修饰也占有一席之地,是当前生命科学的研究热点之一。拜谱生物目前已经建立了N-糖基化修饰组学、O-GlcNAc糖基化组学、完整糖肽蛋白质组学全面的糖蛋白组学服务,其中完整糖肽是2023年推出的新品,基于HILIC富集手段,权威的分析软件同时实现N-糖和O-糖的糖基化位点、糖型、糖肽和糖蛋白的完整解析,并结合最新Orbitrap Astral质谱仪可以完成更高质量的数据检出,推动了糖基化相关的疾病研究。

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产品特点:


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 糖基化的全局分析:一针进样,N-糖和O-糖的完整分析


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尖端Astral质谱仪:更高通量、更深覆盖、更高灵敏度、更精准定量、更高稳定性与重现性


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高效的搜库软件:检索速度快、大规模精准定量


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完整的糖蛋白组学信息:提供糖蛋白+位点+糖肽+糖型+生信分析








超高深度磷酸化修饰蛋白质组

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由于磷酸化的普遍性和功能多样性,使得磷酸化一直是研究最多、最被广泛认知的一种蛋白质修饰。但是,研究完整的磷酸化图谱目前仍然是一个问题。在PhosphoSitePlus(PSP)等数据库中已经收录超过2000000个磷酸化位点,不断刷新着研究者们的已有认知。然而,目前缺乏高深度、高稳定性、高效流程的分析磷酸化修饰组的方法,特别是针对高通量的磷酸化位点定量的检测方法。基于此,拜谱推出的超高深度磷酸化修饰蛋白质组采用独创的磷酸化肽段富集方法+DIA全息扫描技术,显著提高了磷酸化位点的鉴定深度和定量重复性。

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产品特点:


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 全球独创磷酸化富集技术:富集起始量更低、富集效果更好


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DIA全息扫描技术:无差别采集、数据完整、系统稳定、定量精准


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实现更高通量:鉴定深度高达100000+个磷酸化位点








其他修饰组学

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乙酰化是参与组蛋白和非组蛋白调节得关键翻译后修饰过程,它控制DNA转录、RNA修饰、蛋白质稳态、衰老、自噬、细胞骨架结构的调节和新陈代谢等细胞过程。近年来,乙酰化修饰逐渐受到广泛的关注,在Nature、Nature Communication、Molecular Cell等高分期刊上都发表了相关论文。乙酰化作为国自然研究热点之一,2023年乙酰化修饰的国自然中标项目高达140+项。基于此,拜谱生物全新推出超高深度DIA乙酰化修饰蛋白质组,采用CST抗体富集乙酰化修饰肽段,并结合DIA全息扫描方式,有效解决修饰肽段丰度低、检测难等问题,助力解锁乙酰化修饰功能、机制等研究。

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产品特点:


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 高效的富集手段:采用CST抗体富集修饰肽段


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 DIA全息扫描:无差别采集、数据完整、系统稳定、定量精准











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·PART-THREE·



代谢组产品




中药代谢组

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代谢组在中药研究领域的主要应用方向有(1)利用代谢组学技术发现证侯的生物标记物;(2)利用血清药物化学方法发现方剂的体内直接作用物质;(3)在有效性的前提下,通过关联性分析阐明方剂药效物质基础及效应机制。近年来,中药相关项目的国自然经费逐年攀升,通过代谢组学分析中药材的成分和药效物质基础成为当下热门的研究方向。拜谱生物中药代谢组是从中药成分分析到中药入血/组织分析,结合网络药理学分析的中药项目整体解决方案。该产品基于拜谱自建中药数据库BP-TCM(近万种化合物),采用更多的样本技术重复和更长的质谱上机时间,辅以专业团队人工复核,来实现更多、更精准的中药化合物鉴定以及更深层次的中药治病机理挖掘。通过全流程优质服务帮助客户突破传统中药复方机制研究的瓶颈。

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产品特点:


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自建BP-TCM中药库、项目药材数据库


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更多的样本技术重复、更长的上机时间


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 售前+售中+售后全流程服务、人工复核、个性化分析


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中药成分分析及单方归属、入血/组织分析、网络药理学分析








医学全靶代谢-MT 1000 kit 

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代谢物是代谢过程的最终产物或中间体,与生物系统的表型密切相关,控制表型功能的调节,因此比其他“组学”更能反映身体表型。探索代谢组有助于发现并验证疾病标志物,探索肠道菌群和宿主间的脑肠轴信号网络,评估药物/营养治疗的效果评价等。拜谱生物自主研发的MT1000 kit可对1000+种医学专属性代谢物进行准确定性定量分析,全面覆盖极性与非极性、亲水与疏水性功能代谢物,广泛覆盖疾病相关的重要通路,提供最全的疾病分子数据库。MT1000 kit不仅在不同组别之间寻找差异,同时也保证筛选标志性组分的可靠性,无需验证,可适用于人、大鼠、小鼠等动物来源的样本,包括血液、细胞、粪便、组织等多种样本类型。

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产品特点:


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1000+标准品库、提供最全的疾病分子数据库


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双模式分别采集、正负离子overlap少


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 MRM定量金标准、发现与验证一次解决


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 100%物质分类、广泛覆盖重要通路


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极性+非极性、代谢组+脂质组整合检测,通量更高








植物广靶代谢组GT-MAX2.0

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广靶代谢组通过MRM模式采集样本质谱数据与目标离子对匹配,可以同时实现非靶向代谢组“广泛性”和靶向代谢组“准确性”的优点,具有高通量、超灵敏、广覆盖、定性定量准等特点。拜谱生物全新升级的GT-MAX2.0精选包含更多次生代谢物在内的2000+目标离子对进行MRM检测分析,能够对多种不同分类的功能代谢物进行定性定量分析,项目实测代谢物高达1500~2000种植物初生代谢物和次生代谢物,一次检测可同时解决植物代谢物发掘与验证的难题。

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产品特点:


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实测代谢物稳定在1500~2000个


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 精选2000余种代谢物目标离子对信息


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涵盖15类物质,次生代谢物数量占代谢物总量近70%








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·PART-FOUR·



空间多组学




空间多组学

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空间多组学在2022年被Nature杂志评为最值得期待的七大技术之一,通过将肿瘤三维分子结构解构到亚细胞水平,并绘制2023年空间组学的研究依旧如火如荼,成为了Nature、Sicence、Cell等顶刊的常客。拜谱生物现提供空间蛋白组、空间代谢组、空间转录组、单细胞转录组测序等空间多组学系列解决方案。空间蛋白质组产品利用多靶点组织原位微环境单细胞成像技术实现在切片上区分细胞类型、实现可视化成像观察及单细胞分辨率的自由切割以及高通量的蛋白质组学检测。超高分辨空间代谢组是基于新一代质谱成像平台Tim-TOF flex MALDI 2推出的一站式空间代谢组学分析解决方案。通过增加分子分离维度和对“后电离”技术的创新应用,实现对代谢物进行空间分布分析的同时完成高深度的定性定量,为揭示组织微环境高度异质性、不同细胞类型的空间分布、细胞间信号转导网络关系,及其对癌症等重大疾病的发病机制研究提供了重要的分析工具。


空间蛋白组产品特点:

1. 高精准细胞识别:专业图像分析软件

2. 高准确度切割:多色免疫荧光成像,可实现单细胞级别的切割

3. 高回收率收集转移:采用SISPROT极微量蛋白组前处理技术实现微量样品的高效收集

4. 高灵敏度样品前处理:单个样本平均可检出7000-8000个蛋白


空间代谢组产品特点:

1. 采用Tim-TOF flex MALDI 2质谱成像平台,大幅提升灵敏度

2. 高分辨率成像、空间可视化、技术成熟、分辨率5~20μm

3. 增加离子淌度分离、更高的可靠性和特异性








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结语


围绕生物标志物研究、疾病分型与治疗、大队列分析等热点研究,拜谱生物结合常规和特色产品,推出了面向不同样本和研究领域的多组学服务方案,涉及肠道篇、植物篇、医学篇、血液篇等。如肿瘤疾病研究,推荐使用“超高深度血液蛋白质组”、“糖蛋白修饰组学”和“MT1000”等进行血液样本中的蛋白、蛋白修饰、代谢研究;推荐采用“超高深度FFPE蛋白质组”、"DIA-Ultra"等进行肿瘤组织研究,并结合“空间蛋白组”、“空间代谢组”和“单细胞转录组”时空组学多维度分析肿瘤和癌旁组织的异质性。拜谱生物多组学解决方案从基因组、蛋白质组、代谢组等多系统层面和空间角度来理解生物学现象和机制,助力科研,欢迎咨询!

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往期 · 推荐

“繁花”似锦,2023年拜谱生物项目文章盘点:合作项目顶刊“Nature”发文,年度最高69.5分,年度IF平均8+分!

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