Elucidation of Gut Microbiota-Associated Lipids Using LC-MS/MS and 16S rRNA Sequence Analyses. iScience. 2020;23(12):101841.
宿主-微生物群相互作用创造独特的代谢环境,16S核糖体RNA(rRNA) 序列的整合和基于质谱(MS)的脂质组学在揭示细菌组成与肠道代谢网络关系方面具有巨大潜力。
采用非靶向脂质组学,用基于特征的分子质谱/质谱网络来描述小鼠肠道细菌依赖的脂质亚类。遗传和环境因素诱发被称为生态失调的微生物失衡,导致IBD、T2D和自闭症。
粪便中约24.8%脂质分子是微生物依赖,其中一系列与微生物相关的脂质结构,包括酰基-羟基脂肪酸(AAHFA)。基于对985个脂质谱和16S rRNA序列数据综合分析,成功预测负责这些独特脂质合成的细菌种类。

16S rRNA扩增序列分析。脂质分子网络在非靶向分析中无偏倚地捕获了独特的代谢变化,为发现微生物脂质代谢与宿主生物学表型之间的潜在联系开辟了一条新途径。
LC耦合三重四极杆(QqQ)和四极杆飞行时间(QTOF)/MS平台分别进行靶向和非靶向的LC-MS/MS分析,测定小鼠粪便脂质组。
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利用分子谱网络的LC-MS/MS-based 非靶向脂质组学方法揭示了一个全身肠道脂质组,并结合16S rRNA基因序列数据表征了细菌组成与粪便脂质分子之间的关系。


基于特征的分子网络在MS/MS中对AAHFA分子的鉴定

脂质丰度与16S rRNA基因序列间的Spearman热图

分析了对照组和单一抗生素处理组之间微生物谱图和脂质谱之间的Spearman等级相关性。
含有DCA、HDCA、LCA和LCA异构体(脂类C)的次级胆汁酸代谢谱与拟杆菌目(Bacteroidales)和梭状芽孢杆菌目(Clostridiales)(细菌群I和II)的细菌谱呈正相关。
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新鉴定的脂类AAHFA(脂类I)的丰度与拟杆菌科和梭状芽孢杆菌科的细菌呈正相关

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