项目文章|组学发刊快易准!北京农林科学院研究所两篇齐发!利用蛋白组和代谢组寻找什么品种的鸡好吃?养多久最好吃?

两篇齐发!

The theme of this article is Proteomics

“蛋白质组学篇”


Comprehensive Proteomic Characterization of the Pectoralis Major at Three Chronological Ages in Beijing-You Chicken

中文题目:北京油鸡三个不同日龄胸大肌的综合蛋白质组学特征

刊登杂志:Frontiers in Physiology

影响因子:4.566

发表时间:2021.3.18

拜谱生物提供服务:TMT标记定量蛋白质组学  +  PRM靶向验证蛋白质组学

研究对象:北京油鸡胸肌组织

合作客户:北京农林科学院畜牧兽医研究所

 

研究背景


肌肉发育和肉质是受年龄、性别、营养和品种综合影响的性状,其中,动物日龄是能够强烈影响这些特征的最重要因素之一。此外,肌内脂肪(IMF)含量对鸡肉风味也有重要影响。据报道,56 d至140 d的鸡胸肉中IMF含量随着年龄的增加而增加,肉质的风味和口感也随之增强。新兴的定量蛋白质组学技术可以系统研究蛋白质组全表达谱中静态或扰动诱导的变化,并发现不同的肉质生物标志物。然而,早期的蛋白组研究主要集中在商品肉鸡和蛋鸡上,却对中国本土鸡肌肉发育和肉品质的分子机制仍缺乏了解。北京油鸡(BYC)是中国著名的土鸡品种,在中国更受欢迎,因为它的味道、浓郁的香味和柔嫩口感。然而,在中国,确定黄鸡上市日龄的标准由于消费者的偏好而有所不同,不同日龄的黄鸡的蛋白质图谱可能会表现出很大的差异。因此,该研究采用基于质谱的定量蛋白质组学技术对不同日龄的北京油鸡肌肉进行检测与分析。

 

研究思路



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主要结果展示



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火山图:120日龄vs 90日龄;150日龄vs 120日龄


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GO富集:120日龄vs 90日龄;150日龄vs 90日龄


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KEGG富集:120日龄vs 90日龄;150日龄vs 120日龄


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蛋白通路互作网络:120日龄vs 90日龄;150日龄vs 120日龄

 


研究结论


该研究比较了BYC在90天(快速生长日龄)、120天(超高品质市场日龄)和150天(鸟类开产日龄)的蛋白质表达谱和相关生物标志物对胸肌发育和肉品质的影响。此外,一些候选蛋白通过靶向平行反应监测(PRM)方法进行验证。这项研究可以提高我们对发育过程中时间表达谱的认识,并为探索肌肉发育和肉类品质的生物学机制和表征生物标志物提供机会。

 


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两篇齐发!

The theme of this article is Metabonomics

“代谢组学篇”



UHPLC-QTOF/MS-based comparative metabolomics in pectoralis major of fast- and slow-growing chickens at market ages

中文题目:上市日龄快、慢生长鸡的胸大肌代谢组学研究

刊登杂志:Food Science & Nutrition

影响因子:2.863

发表时间:2021.11.5

研究对象:北京油鸡和白羽肉鸡的胸肌组织。

拜谱生物提供服务:LC-MS/MS非靶向代谢组学

合作客户:北京农林科学院畜牧兽医研究所

 




研究背景



在过去的几十年里,遗传技术大大提高了快速生长肉鸡的产量。然而,这对肉鸡口味品质有不利影响,比如肉质更差、肌肉纤维退化更多、血浆肌酸激酶浓度更高。因此,越来越多消费者选择传统的、生长缓慢的、黄色羽毛的鸡品种,比如北京油鸡(BYC)。相比之下,白羽肉鸡(Cobb500)是一种著名的基因改良商品肉鸡,具有优异的生长率和肉产量,尤其是胸肌产量。一般认为,传统的慢生鸡基因型比快生鸡基因型具有更好的品质。然而,现在缺乏对市场日龄不同基因型鸡肉质量差异的清晰认识,导致鸡肉品质变化的生物过程和分子途径在很大程度上仍是未知的,特别是对肌肉内源性代谢物的分析研究还很少。代谢组学研究的是生物体、组织或细胞中在已知条件下的全部小分子代谢产物,在牲畜健康、育种和生产等方面都有很好的应用。因此,该研究对两种基因型鸡肉BYC和Cobb500进行了代谢组学检测与分析。

 



研究思路


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主要结果展示


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多元统计分析

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聚类趋势热图


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通路富集气泡图


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甘油磷脂代谢通路网络

 



研究结论


本研究通过基于质谱的LC-MS/MS非靶向代谢组学技术,对商品快生鸡(Cobb500)和本地慢生鸡(BYC)肉质差异的代谢特征和代谢途径进行了鉴定,并且利用验证数据对潜在的代谢生物标志物进行了评估,最终揭示了不同基因型鸡肉品质相关的潜在机制。



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