云聚高效·智赋未来|拜谱生物打造BioCloud数据分析云平台正式上线!
拜谱生物打造BioCloud云平台即日起正式上线,长篇码字敲代码?分析图无从下手?分析结果选择困难?云平台助您快速解决,人人都能做数据分析。
拜谱生物注重科研成果转化及呈现,为搭建一个通用性的数据分析平台,设计功能化、模块化的生信分析工具箱,帮助用户进行数据可视化和功能分析,提高对数据的直观认识,化繁为简的操作方法助力生命科学研究成果高效产出。BioCloud目前对广大科研工作者提供免费使用权限,注册即用!可享30+数据分析内容。


云聚高效·智赋未来|拜谱生物打造BioCloud数据分析云平台正式上线!




功能化、模块化的生信分析工具箱


BioCloud目前涵盖9大分析模块,30+分析内容,不仅可以对生物学数据进行可视化,还可以对基因/蛋白进行功能富集分析,基本满足用户的常用应用场景。

  • 差异分析:火山图,Venn图,Upset图

  • 聚类及相关性分析:表达聚类热图,相关性散点图,相关性热图,相关性upp图

  • 比例分布:堆叠柱状图,分线图,峰峦图,云雨图,饼图,甜甜圈图

  • 功能富集分析:GO富集,KEGG富集

  • 多组数据可视化:多组柱状图,棒棒糖图,气泡图

  • 样本比较分析:PCA,T-SNE,区域散点图

  • 表达分布:箱线图,小提琴图,半小提琴图,分组柱状图,折线图,配对柱状图,玫瑰图

  • 概率密度分布:概率密度分布图,二维概率密度分布图,概率密度散点图

  • GWASQQ图,曼哈顿图

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   1. BioCloud云平台30+个数据分析内容

简单易用、化繁为简的操作方法



拜谱生物BioCloud云平台不仅集合了30+个功能化、模块化的生物数据分析小工具,在设计的时候也考虑到了用户操作时简单易用、化繁为简的需求与体验。


简约不简单的界面布局

作图界面分为5部分,如下图所示:


  • 功能模块索引:30+个数据分析小工具按照其功能应用场景分为9大模块
  • 示例数据及格式说明:该区域说明了数据格式要求,并提供了“示例数据”,可以一键下载查看demo数据,指导用户进行数据准备
  • 操作区:上传数据文件,设置绘图参数,提交操作即可获得数据分析可视化图片
  • 图形展示区:demo例图和用户提交的实际分析图都将在此处展示,后续可以下载保存图片
  • 表格区:提交数据后的云分析统计结果将在此处展示出来,比如相关性分析的相关性系数,功能富集分析的ratio、p-value和count


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2. BioCloud云平台作图界面布局


操作易用,人性化设计

使用BioCloud绘图时,用户仅需按照示例数据及格式说明整理自己的数据,然后在操作区上传文件、调整参数、提交查看,最后在图形展示区下载保存图片。在简捷的操作过程中,数据准备和参数设置是关键。因此BioCloud在这两步中提供了人性化的设置,详情如下:
1.数据输入简单,支持常见的组学定量矩阵
       
通常在进行可视化前,首先需要根据图表的要求计算相关的指标,如相关性系数、统计数值等,这无疑增加了用户的使用难度和数据准备时间,因此BioCloud在研发过程中,在原有绘图R包中增加了统计函数,使得我们可以基于常见的组学定量矩阵(如下表)直接进行相关性热图、云雨图、PCA等作图,使用户操作更简便快捷。

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  3.相关性分析的输入与输出


      
我们再以“GO富集和KEGG通路富集”为例,用户仅需输入目标gene symbol,选择相应物种,云平台实时关联数据库,会自动匹配该物种对应的gene ID,然后进行富集分析,统计计算count、ratio和p-value,一键操作,省心省事省力。

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   4. KEGG通路富集分析的输入与输出


2.个性化参数设置,轻松提高美观度
     
 除了简单易用,用户最关心的就是美观的问题。因此BioCloud设置了一些非必填参数,用于提交绘图后自定义地调整图片,比如坐标轴和图例设置,选择配色样式,我们提供了lancet、npg、nejm、jama和d3等顶级期刊的经典配色,除此之外,还有更丰富的自主配色可供选择和使用。

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   5.个性化参数设置



拜谱小结


作为多组学领域领先企业,拜谱生物希望在各个环节给到老师最优质的服务,从业内独家的研发产品到个性化免费开放BioCloud我们时刻关注老师们的需求体验。

BioCloud为大家提供了一个开源性数据分析平台,对9个功能模块,30+个数据分析内容提供免费使用权限,希望帮助每一位科研用户快速高效的分析并可视化实验数据。如果您有任何问题和需求可以直接联系我们,BioCloud在科研道路上与您同行,成就组学数据精彩。



登录指南


  1. 浏览器登录拜谱生物官网:www.bioprofile.cn

  2. 点击进入“产品服务”

  3. 点击“BioCloud云平台登录”

  4. 进入BioCloud云平台页面,注册登录后即可尊享30+数据分析内容

(建议使用Chrome等主流浏览器)云聚高效·智赋未来|拜谱生物打造BioCloud数据分析云平台正式上线!
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