推荐收藏!国际肿瘤学期刊Oncogene主编王英杰教授12月2日直播回放+在线提问合集

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在线Q&A整理:

 


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王英杰教授答疑


 

提问:“王教授听介绍您发了挺多很好的文章,请问做了磷酸化修饰组学在加基础生理生化指标实验可以发到几分文章”

 

答:现在做修饰组学的研究变得越来越多了,如果单纯做一些磷酸化然后结合生理指标的话可能不能发很高的文章了,如果把基因、蛋白以及下游的代谢相结合,去进行一个更全面的科学探索,可能会研究的更全面一些。

 

提问:“王教授您好,请问质谱鉴定时发现蛋白的同一个位点存在两种不同的修饰,该怎么解释呢?”

 

答:一个蛋白存在两个不同的修饰位点,这两个修饰位点存在一定的竞争限制。这种情况是比较常见的。

 

提问:“王教授,请问如果coip后用质谱检测到可能与蛋白A的互作蛋白是泛素化蛋白Uba52,那么接下来想往下做Uba52的调控蛋白应该是怎样的思路呢”

 

答:一是可以尝试做敲除或者过表达,观察相关代谢通路的变化;

二是可以对目标蛋白的修饰位点做突变,观察修饰水平以及相关代谢通路的变化。


 


02

曲蕊老师答疑



提问:“如果筛选出差异性蛋白,是不是可以利用自己有的液质去做特定蛋白的定量比对?”

 

:可以的,利用不同平台的LC-MS对组学的结果进行验证是一种十分常见的方式。例如,非靶代谢组学常用飞行质谱等高分辨率质谱仪进行样品分析,而靶向验证则一般使用三重四级杆质谱仪进行定量分析。

 

提问:“靶蛋白上面看一下是否发生磷酸化修饰,应该怎么做?”

:

方法一:当缺乏高特异性抗体时,可以直接尝试做磷酸化修饰组学,从结果中查看目标蛋白的磷酸化修饰状况。

方法二:可以先用高特异性抗体富集目标蛋白,再利用质谱进行目标蛋白的磷酸化位点分析。

 

提问:“mirna测序没有吗,我看只有lncrna”

:ppt仅列出了部分核心产品,mirna测序这个产品我们公司也是有的,针对具体的产品问题,老师们可以直接联系我们的区域负责人或者技术支持,他们将向各位老师提供详细的解答。

 

提问:“我也想做修饰组学的内容,请问如果要做修饰组学的话,比如磷酸化我该怎么设置实验”

:我们设计实验常规思路是首先设置好差异比较组(处理、胁迫等),其次是利用修饰蛋白质组学技术去筛选差异蛋白,然后根据差异蛋白去进行一系列生信分析。后续还可以用我们的PRM去验证我们的组学数据。

 

 

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