重磅出击 | 完整糖肽蛋白质组学邀您领略“糖门”的独特风采
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糖基化修饰是一种重要的翻译后修饰,可改变分子结构的特异性,影响细胞间的识别、黏附、代谢及免疫等过程,从而影响疾病的发生发展过程。由于糖基化的同一个氨基酸位点上会被修饰多种糖型,采用的糖苷酶切去糖链后分析残余的肽段骨架方法分析不全面等问题,这为糖基化肽段的识别和糖型的鉴定带来了极大的挑战。

拜谱生物全新推出的完整糖肽蛋白质组学是基于HILIC富集手段,权威的分析软件同时实现N-糖和O-糖的糖基化位点、糖型、糖肽和糖蛋白的完整解析,并结合最新Orbitrap Astral质谱仪可以完成更高质量的数据检出。





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产品技术


完整糖肽蛋白质组研究的主要步骤包括:蛋白质提取、蛋白质定量、蛋白质酶解、完整糖基化肽段富集、LC-MS/MS分析、数据库检索、数据分析和实验报告等。

流程如下图所示:

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图1完整糖肽蛋白质组学的技术路线





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产品特点




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完整糖肽蛋白质

01

糖基化的全局分析

一针进样,N-糖和O-糖的完整分析

02

尖端Astral质谱仪

更高通量、更深覆盖、更高灵敏度、更精准定量、更高稳定性与重现性

03

高效的搜库软件

检索速度快、大规模精准定量

04

完整的糖蛋白组学信息

提供糖蛋白+位点+糖肽+糖型+生信分析

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应用方向


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疾病机制研究

应用案例:类风湿关节炎

文献名称:Integrative proteomics and N-glycoproteomics analyses of rheumatoid arthritis synovium reveal immune-associated glycopeptides

发表期刊:Molecular and Cellular Proteomics

发表时间:2023年5月

技术方法:完整N-糖肽

样品类型:类风湿关节炎(RA)和骨关节炎(OA)滑膜组织

研究内容:

类风湿关节炎(RA)是一种典型的自身免疫性疾病,其特征是滑膜炎症、滑膜组织增生以及骨和软骨的破坏。蛋白质糖基化在RA的发病机制中起关键作用,但滑膜组织的糖蛋白组学分析仍然缺乏。本研究通过完整N-糖肽蛋白质组学技术,从RA滑膜334个糖蛋白的481个N-糖位点中鉴定出1269个糖肽。生物信息学分析表明RA中的高糖基化蛋白与免疫反应密切相关,一些N-糖肽与某些免疫细胞的过滤相关。这项研究描述了免疫相关的糖基化,为RA的发病机制提供了新的见解。

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图2 类风湿关节炎的发病机制探究

(图源:Xu Z, et al., Mol Cell Proteomics, 2023 )


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生物标志物研究 

应用案例:肝脏疾病

文献名称:High-throughput site-specific N-glycoproteomics reveals glyco-signatures for liver disease diagnosis

发表期刊:National Science Review

发表时间:2023年1月

技术方法:完整N-糖肽

样本类型:肝病患者的血清样本

研究内容:

IgG是循环系统中最丰富的免疫球蛋白,它们具有识别和清除外来抗原和病原体的功能。IgG的N-糖基化与肝脏的发病和进展有关,在调节IgG受体介导的功能反应中起关键作用。然而,以往的研究缺乏IgG亚类特异性和N-糖基化的信息。本研究通过完整N-糖肽蛋白质组学分析揭示了与肝病相关的特定糖肽,并且发现N-糖肽在疾病进展中具有不同的趋势。同时,最大的亚类特异性和位点特异性的人血清IgG N-糖基化数据集被报道,IgG中N -糖肽可以用于评估肝脏疾病的严重程度。总之,结果表明肝脏疾病的不同临床阶段可以通过糖标记来区分,这为精准医学和疾病靶向治疗提供了依据。

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图3 肝脏疾病的生物标志物研究

(图源:Sun Z, et al., Natl Sci Rev, 2023)


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疾病特征及诊断治疗研究

应用案例:透明细胞肾细胞癌(ccRCC)

文献名称:Integrated glycoproteomic characterization of clear cell renal cell carcinoma

发表期刊:Cell Reports

发表时间:2023年5月

技术方法:完整N-糖肽

样本类型:ccRCC组织样本

研究内容:

ccRCC是一种常见的肾细胞癌,是导致肾癌高死亡率的原因。糖蛋白失调已被证明与ccRCC有关,但是其中的分子机制尚未得到表征。本研究对103例肿瘤和80例正常邻近组织进行了全面的糖蛋白组学分析,发现糖基化酶和相应的蛋白糖基化发生改变,并且ccRCC两个主要的突变BAP1和PBRM1显示出不同的糖基化谱。研究结果表明与癌症进展和侵袭性相关的特定聚糖类型,糖蛋白组学亚型以及糖基化和磷酸化的联合分析为ccRCC患者分层提供了新方法,这为肾细胞瘤的未来开发诊断和治疗方案奠定了基础。

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图4 ccRCC的特征及诊断治疗研究

(图源:Lih TM, et al., Cell Rep, 2023)


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送样建议


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拜谱小结


蛋白质的糖基化是一种重要的翻译后修饰,它涉及多种生物途径和分子功能。拜谱生物全新推出了完整糖肽蛋白质组学服务,同时包含N-糖和O-糖的定量分析,能够实现糖基化位点、糖型、糖肽和糖蛋白的完整解析,由此建立了N-糖基化修饰组学、O-GlcNAc糖基化组学、完整糖肽蛋白质组学全面的糖蛋白组学服务。欢迎大家咨询!




参考文献:

[1] Xu Z, Liu Y, He S, et al. Integrative proteomics and N-glycoproteomics analyses of rheumatoid arthritis synovium reveal immune-associated glycopeptides. Mol Cell Proteomics. 2023 May;22(5):100540. doi: 10.1016/j.mcpro.2023.100540.

[2] Sun Z, Fu B, Wang G, et al. High-throughput site-specific N-glycoproteomics reveals glyco-signatures for liver disease diagnosis. Natl Sci Rev. 2023;10(1):nwac059. doi: 10.1093/nsr/nwac059.

[3] Lih TM, Cho KC, Schnaubelt M, et al. Integrated glycoproteomic characterization of clear cell renal cell carcinoma. Cell Rep. 2023;42(5):112409. doi: 10.1016/j.celrep.2023.112409.




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