精准细胞识别,探索生命奥秘的新利器——空间蛋白质组
精准细胞识别,探索生命奥秘的新利器——空间蛋白质组

细胞是构成生物体的基本单位,存在显著的异质性,同时细胞对应的空间信息对细胞功能、细胞间相互作用、细胞异质性研究十分重要。常规的蛋白质组学研究结果往往是一群细胞的平均水平,且缺少细胞的空间信息,难以满足深入探究生命功能的需求。

拜谱生物现推出空间蛋白质组产品,利用多靶点组织原位微环境单细胞成像技术实现在切片上区分细胞类型;结合新型激光显微切割技术实现在LCM平台上可视化成像观察及单细胞分辨率的自由切割;通过SISPROT全集成化高灵敏度样品前处理技术和4D-DIA质谱检测技术进行高通量的蛋白质组学检测,可对纳克级样本实现毫克级样本检测深度,单个样本平均可检出7000-8000个蛋白。

精准细胞识别,探索生命奥秘的新利器——空间蛋白质组





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产品特色




1.高精准度细胞识别

在常规空间蛋白质组依赖HE染色技术上,创新性地引入多色免疫荧光,结合专业图像分析软件可对不同类型细胞自动识别定位、特定类型细胞的单细胞级别筛选、组织微环境分布分析等。

精准细胞识别,探索生命奥秘的新利器——空间蛋白质组

单细胞筛选及细胞群识别


2.高准确度精密切割

在常规LCM技术上进行优化,在LCM平台上实现基于多色免疫荧光成像结果的实时成像观察,根据客户需求选定目标区域进行自动化动激光显微切割,可实现单细胞级别的切割。

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成像图片引导LCM切割


3.高回收率收集转移、高灵敏度样品前处理

相比常规蛋白质组学样品前处理方法,采用SISPROT极微量蛋白组前处理技术,通过多步骤的有效整合得以省略冻干和样品转移步骤,减少样本损失,实现微量样品的高效收集;并且其专有的移液枪尖端引入了纳米孔材料来进行样本富集,将所需样本量从毫克级减少至纳克级。

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SISPROT应用于空间蛋白质组学

(图源:Tian RJ, et al., Anal Chim Acta. 2020)


4.高深度质谱检测

通过整理多种先进技术,可实现高深度的蛋白组学检测,单个样本平均可检出7000-8000个蛋白。在保证高深度检测的同时,不同细胞类型的样品可显著性区分并特异性聚类。

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产品应用



拜谱生物推出的空间蛋白质组学产品可实现对病理切片中特定空间位置组织微环境(例如单细胞空间定位、组织结构等)在成像及蛋白表达等层面进行系统的定位、定性和定量分析,为揭示组织微环境高度异质性、不同细胞类型的空间分布、细胞间信号转导网络关系,及其对癌症等重大疾病的发病机制研究提供了重要的分析工具。

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 空间蛋白组临床应用

(图源:Mund A, et al., Mol Cell, 2022)






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送样建议




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拜谱小结




随着空间组学热度与日俱增,空间蛋白质组学技术已经成为一个新的组学风口。既拜谱生物成功推出空间代谢组、空间转录组、单细胞测序等产品之后,拜谱推出了空间蛋白质组产品,实现单细胞分辨率的自动化识别、切割、样品前处理及数据分析的完整空间蛋白质组技术服务。拜谱生物现已建立从单细胞样本到完整组织、从小样本到大队列、从非靶向到靶向、从时间到空间的完整产品体系,欢迎咨询!



参考文献:

[1] Huang P, Kong Q, Gao W, et al. Spatial proteome profiling by immunohistochemistry-based laser capture microdissection and data-independent acquisition proteomics. Anal Chim Acta. 2020;1127:140-148. doi:10.1016/j.aca.2020.06.049

[2]Mao Y, Wang X, Huang P, Tian R. Spatial proteomics for understanding the tissue microenvironment. Analyst. 2021;146(12):3777-3798. doi:10.1039/d1an00472g

[3]Mund A, Brunner AD, Mann M. Unbiased spatial proteomics with single-cell resolution in tissues. Mol Cell. 2022;82(12):2335-2349. doi:10.1016/j.molcel.2022.05.022

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