方法简介

质谱法能对侧链基团翻译后加工或化学修饰进行定位，且弥补了传统的Edman降解法不适用于N端封闭的缺陷。且蛋白质的C末端分析并不能采取类似N端的化学分析，现阶段是采取质谱法对蛋白质样品的C末端序列进行分析。质谱法N/C端测序可以用于确认重组蛋白是否得到完整表达，以及重组蛋白N端和C端序列是否发生修饰。我们首先分析靶蛋白的氨基酸序列信息，选择特定的蛋白酶对靶蛋白进行酶切，得到合适长度的蛋白质N端和C端肽段，然后进行质谱分析，确认靶蛋白的N端和C端序列信息。

样品要求

关于样品：可以提供蛋白冻干粉或蛋白质溶液；至少需要20ug的蛋白质，纯度>90% ；含盐量：挥发性无机盐<20mM，不挥发性无机盐<5mM；蛋白溶液避免SDS等变性剂，表面活性剂，不含tris缓冲体系。

样品运输：请使用足量的干冰运输，并尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。

案例分析